|
3#
樓主 |
發表於 2008-1-22 14:48:16
|
只看該作者
把世界放進成大 與美國ISB共享頂尖研究資源
" |2 z% c0 c7 ]* x/ H& m透過即時通的視訊平台,成大師生與美國系統生物學中心的對話零距離。
4 d4 n! V4 a3 N+ b8 X& h2 F
3 U9 [9 b' f. }6 } \! O8 J(20080122 11:38:54台南)在國際化的進程,成功大學大有斬獲,透過與美國系統生物學中心(Institute for Systems Biology, ISB)國際合作平台,把世界放進成大,成功地把世界頂尖研究中心納為自己的研究空間,締造學生不出國也能坐擁世界一流研究中心、共享世界頂尖的資源之先例。成大資訊工程所教授蔣榮先說,在e化的時代,網路無遠弗屆,透過即時通的視訊平台讓成大師生與美國系統生物學中心的對話零距離。- q4 q+ \0 Y' Q* s4 t% [
' C' h' |( u$ h# M" H/ s
美國系統生物學中心(Institute for Systems Biology, ISB)是全世界第一個系統生物研究中心,成功大學在2007年6月與美國系統生物學中心簽訂合作協議書,隨即於七月送出資訊工程研究所教授蔣榮先指導的李宗儒及劉恆惠等兩名博士班學生,並透過定期及不定期的視訊會議,與在美國系統生物學中心研究的兩名博士生進行密集的書報討論及專題報告,除指導老師可以在第一時間充分掌握兩名博士生的研究進度,此外博士生也能即時回報在美國系統生物學中心所獲得的最新研究資訊與技術,並以對談及意見交換的方式嘉惠給實驗室其他的研究生,協助校內研究生適時解決一些研究上的瓶頸。例如把分析癌症基因顯著性之數據傳給在美國系統生物學中心(ISB)的兩名博士生,然後再利用美國系統生物學中心的尖端技術加以解讀而獲得更多突破性的成果。% D* O0 J/ J m) p! R
! `; L7 n" P M+ v* A
成大資訊工程所博士班學生李宗儒及劉恆惠在美國系統生物學中心研修四至六個月,學習新型專利表現資料之資料庫,七月到美國系統生物學中心,依照指導老師蔣榮先教授的指示,每週最少進行兩次固定的書報討論及專題報告視訊連線對話,在視訊的溝通平台上,兩名博士生與指導老師以及多名研究生,除廣泛交換研究心得與最新研究資訊,也把在成大研究所遇到的困難利用美國系統生物學中心的設備與技術加以解決,不僅加速縮短研究時程,亦大幅提昇研究的質與量。
3 t4 t) \% S; Q9 x
9 [& c7 J; y" y7 `3 k# G+ b: C6 C. c# N李宗儒說,能到美國西雅圖ISB研究是非常難得的機會,他特別感謝指導教授蔣榮先與ISB的Dr. Hood博士的極力爭取及成大五年五百億頂尖大學研究計畫的挹注,使得雙方的合作從一踏到美國西雅圖就非常順利。
( O: q$ ~" I% q; ]0 ?0 ?, r! g( t: i$ N; c2 h; U
在美國ISB研究的過程中,李宗儒等二位博士生印象最深刻的是ISB開放及鼓勵的氛圍。李宗儒說,在ISB隨處都可以找到白板跟沙發,也總會看見三兩個人端著咖啡在白板前或坐在沙發上討論。此外,ISB裡的研究人員也很習慣跟不同專長領域的研究人員交流合作。在ISB集合了電腦、生醫、物理等專長的人才,並透過討論可以從不同觀點去思考問題,有如此優質的工作文化,使得ISB備受國際矚目與肯定。
1 v8 |/ w3 R) a/ o; j# a. k4 @6 h* ?* @% V; w. V1 }
李宗儒目前在Dr. Hood博士的實驗室進行研究工作,與多位世界頂尖的研究員合作,合作項目包括前列腺癌、肝癌、卵巢癌、血癌、血液和免疫相關疾病、狂牛症、幹細胞研究和老化等。此研究的資料都是由世界頂尖的研究單位取得,其中,包括史丹佛幹細胞和癌症研究中心和多個西雅圖的研究機構和醫院等單位。
: i/ v s, T/ h% W0 k6 h* L+ L4 p% N: X- @) h0 D b" J7 Y4 _; P5 h
李宗儒說明,在ISB每週都有許多大型的和內部的研討會,不同領域的研究人員互相討論、合作,以他而言,他是以系統生物學和生物資訊學的角度來分析所處理的問題,非常需要和生物學者和癌症研究學家做密切的討論和資訊交換。由於ISB鼓勵跨領域合作的工作文化,在短短幾個月中陸續完成兩篇國際知名期刊的投稿,他表示,在ISB從事研究是一個難得的經驗。
. w) M1 r1 L" D! {" ?' I. y, [# \6 c9 R
成功大學在邁向世界百大的過程中,積極與國外知名機構合作、完成與頂尖的研究團隊一起工作的夢想,以達到擴大國際視野及提升研究水平。由蔣榮先教授主持的智慧型資訊擷取實驗室(Intelligent Information Retrieval Lab: IIR Lab) 是國內第一個受ISB邀請的合作機構。智慧型資訊擷取實驗室在資料探勘、文件探勘、人工智慧與資料分群等主題已紮下深厚基礎及卓越研究成果,除發展了許多智慧型的方法來找尋文獻中所隱含的資訊並進行分析,並應用於不同的研究主題上。近幾年來更不斷地發展新技術於生物資訊相關研究,例如:protein-protein interaction、gene name normalization、biological pathway與regulatory network,且發展出數套相關生醫研究系統。" |# L& b2 @3 A, N# ?6 f
2 [% W6 p( @4 d H
過去,蔣榮先教授帶領智慧型資訊擷取實驗室團隊的成員,與成大醫學院合作的膀胱癌研究國科會計畫,曾開發了一套名為GeneLibrarian的系統,用以幫助研究人員自PubMed的摘要文獻中找出與其查詢基因相關的疾病、功能及其他基因,且能夠針對輸入基因列表中的基因進行功能相似性的語意分析,然後以視覺化的方式呈現給使用者,幫助了解實驗得到的基因列表中的基因功能(包括molecular function, biological process以及cellular component)的分佈狀況。對此,美國ISB給予高度的評價。
' u5 |6 ~- R- l# \# M$ @% B! x; u: E
目前,成大智慧型資訊擷取實驗室與ISB的合作計畫是進行卵巢癌的研究,試圖從系統生物學的角度進行分析,以較全面性、系統化的方法去了解在化療過程中,各個基因所扮演的角色及相互之間的關係,並透過ISB的技術幫助了解卵巢癌化學治療的反應路徑,並找到關鍵的調控網路(regulatory network)。蔣榮先教授說,藉由與ISB頂尖研究團隊的國際合作,將有助於成大系統生物學相關研究學者們相互腦力激盪,預期在未來的生物標誌(biomarker)之找尋、系統化分析癌症與個人化醫療上能作更多的研究及貢獻。" D! E$ ~% Q8 n% `) T* A6 u
" a& U& z* s' w0 _
蔣榮先教授補充說明,未來系統生物學的目標是希望轉型成為預防性醫學的基礎,從現今所發展的工具與技術應用於發展預測性、預防性與個人化醫療的世代 (predictive, preventive, and personalized medicine)。當前的DNA定序的成本太過昂貴,以至於普及化變得不可行,而新一代的科學家致力於研發一套新的定序機器以降低DNA定序成本,若能將成本降低至美金1000元,則可以邁向個人基因體 ($1000 Genome)的時代。如此一來可以輕易解碼個人基因的秘密。未來也可以幫助醫生來進行更精確的診斷與治療。如果新生兒出生時就進行個人基因體定序成為事實,而未來一生所有可能發生的疾病與醫療教戰守則都可以放入一片DVD中儲存。 F; x0 T4 K* ^7 P) j! o: Z
2 g3 d3 f5 f# a1 n' b$ D
美國ISB是由人類基因研究權威和美國國家級科學院士Dr. Hood與Dr. Alan Aderem及Dr. Ruedi Aebersold等三人於2000年在美國西雅圖所創立,在短短幾年中,已發展成為美國重要的癌症研究中心之一,在最近的科學影響力評價中,更是超越哈佛等知名的研究中心。目前該中心有來全自球頂尖的研究員170名,每年從國家及私人機構獲得高達三千萬美金的研究經費。聚集了來自生物、數學、資訊、物理等領域的人才,提供了一個少見且優質的跨領域合作的工作環境。最初的使命是希望能夠發展並應用系統化的方法以瞭解複雜生物系統之運作方式,以期能夠為當時的生物學及醫學注入一股新的研究氣象。終極目標則是希望藉由系統生物學這門科學來促進預防醫學以及個人化醫療的發展,從而改善人們的生活品質。ISB更是第一個系統化地研究生物體中信號傳導途徑的先驅,在預防性醫學及個人化醫療上也具有舉足輕重的地位。+ |- V0 Q$ w! B+ Z$ o0 f9 @
1 D! N+ z! [0 XISB正致力於推動P4 Medicine以建立更完善的醫藥診斷體系,未來的目標是只要以美金1000元的就能取得個人化人類基因定序,不僅能提升目前對人類基因定序的科技,更能全面性的研究家庭遺傳和癌症等基因相關疾病,是非常有前瞻性的計畫和方向。1 I5 G; X) G0 F
; e. y G" [' P9 O( I/ s/ C在基因體醫學時代中,如果事先知道某種基因模式在某種環境下可能會產生某種變異,便可以提早採取預防性的治療。例:女性在60歲時其mutant breast cancer 1 gene (BRCA-1) 這個基因有高達70%的機率會發生變異而導致乳癌的發生。我們的目的在於利用這些個人相關的健康資訊,藉由發展有效的方法來了解每個人遺傳模式可能造成的健康潛在問題。如果在60歲時有可能發生乳癌,若提前在45歲即進行相關的治療,則可降低乳癌發生率,因此可以達到預防性醫療的目的。未來將可以更容易地獲得更多個人化健康資訊,然後根據個人狀況的不同而給予對應的醫療照護來實現個人化醫療。 |
|